More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4806 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4806  MFS family transporter  100 
 
 		 438 aa  850    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55220  MFS family transporter  94.52 
 
 		 438 aa  715    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.872465  hitchhiker  0.00000012197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  68.59 
 
 		 473 aa  564  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1258  major facilitator family transporter  69.9 
 
 		 485 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1404  major facilitator family transporter  69.46 
 
 		 482 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0383  major facilitator family transporter  68.8 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1862  major facilitator family transporter  68.8 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760818  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1100  major facilitator family transporter  68.8 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513292  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1266  major facilitator family transporter  69.04 
 
 		 429 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0766  major facilitator family transporter  68.8 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  49.75 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  47.02 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  47.01 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  44.37 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  47.42 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  47.34 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  46.82 
 
 		 437 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  47.09 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 443 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 443 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  48.65 
 
 		 439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  47.89 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 445 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2565  General substrate transporter  46.48 
 
 		 436 aa  320  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0129523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2290  general substrate transporter  46.48 
 
 		 436 aa  320  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.931887  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  44.23 
 
 		 420 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  43 
 
 		 438 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  43.98 
 
 		 445 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  47.19 
 
 		 441 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  47.19 
 
 		 441 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  47.19 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  42.73 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 461 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 431 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 425 aa  296  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  43.86 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 438 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 		 438 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  42 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2097  general substrate transporter  42.23 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00320357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.39 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 428 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  41.83 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 428 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  40.73 
 
 		 435 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  40.73 
 
 		 435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  40.73 
 
 		 435 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 435 aa  286  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  40.29 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  41.08 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  42 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  40.29 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  40.29 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  40.29 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  40.29 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  40.29 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  40.29 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  40.24 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  40.05 
 
 		 435 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  40.7 
 
 		 417 aa  282  9e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 432 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  42.14 
 
 		 430 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.84 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.59 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  41.83 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 		 425 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>