97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4872 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4872  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1338  extracellular solute-binding protein  92.07 
 
 		 289 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.718628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1539  extracellular solute-binding protein family 3  91.03 
 
 		 289 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2410  extracellular solute-binding protein  70.54 
 
 		 286 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3623  extracellular solute-binding protein  66.15 
 
 		 285 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175037  normal  0.0350422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0692  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0808648  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3087  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2256  hypothetical protein  31.06 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2676  periplasmic binding protein, putative  34.13 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1856  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3127  extracellular solute-binding protein  33.11 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146879  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1002  hypothetical protein  35.76 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2662  hypothetical protein  32.71 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.711055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0737  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.390788  normal  0.0887326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1889  hypothetical protein  28.38 
 
 		 296 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1959  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369484  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2484  extracellular solute-binding protein family 3  32.94 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2090  extracellular solute-binding protein family 3  33.46 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6250  extracellular solute-binding protein family 3  34.63 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2815  extracellular solute-binding protein family 3  32.82 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1776  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2731  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.476445  normal  0.605201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1788  periplasmic binding protein, putative  31.03 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000915129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0481  periplasmic binding protein, putative  32.43 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3735  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  27.15 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  27.15 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.61 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  22.56 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  28.1 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.59 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  26.98 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  23.62 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.13 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2595  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  25.65 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.73 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.5 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  27.21 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  25.48 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  26.85 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  23.75 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.81 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.74 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  22.61 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.74 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  24.54 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.68 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  24.54 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  21.2 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  24.54 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  22.62 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  22.93 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  21.2 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  23.24 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.32 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  21.2 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.75 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  39.71 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  29.75 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.75 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  37.08 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7667  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  23.46 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  25.96 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.88 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  24.43 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  30.77 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  23.32 
 
 		 267 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>