68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1021 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  100 
 
 
144 aa  293  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  84.46 
 
 
148 aa  237  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  84.25 
 
 
146 aa  235  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  64.58 
 
 
144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  52.27 
 
 
151 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  48.95 
 
 
173 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  56.9 
 
 
146 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  57.52 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  46.03 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  45.99 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  44.72 
 
 
168 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  44.72 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  48.8 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  44.53 
 
 
152 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  42.86 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  47.58 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  47.79 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  43.75 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  47.46 
 
 
187 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  39.6 
 
 
161 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  39.57 
 
 
147 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  42.45 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  40.34 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  40.34 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  42.27 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  39.83 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  38.66 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  43.1 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  44.8 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  43.48 
 
 
144 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  42.86 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  33.93 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  29.63 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  33.68 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  31.3 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  30.97 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  34.48 
 
 
139 aa  52  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  35.35 
 
 
347 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  31.31 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  28.44 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  29.52 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  29.91 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  30.93 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  30.93 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  29.57 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  32.56 
 
 
255 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  29.57 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  28.7 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  30.09 
 
 
119 aa  47.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  32 
 
 
292 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  30.53 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  28.09 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  28.97 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  32.29 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  28.71 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  28.89 
 
 
221 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  33.7 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  30.21 
 
 
210 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  26.96 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  27.37 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  28.32 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  30.21 
 
 
224 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  29.03 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  29.03 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  28.71 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  29.59 
 
 
186 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  30.93 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  32.65 
 
 
209 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>