174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0751 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  67.32 
 
 		 483 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  67.59 
 
 		 485 aa  667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  94.34 
 
 		 479 aa  919    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 		 479 aa  989    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  67.15 
 
 		 491 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  94.97 
 
 		 479 aa  926    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  85.03 
 
 		 481 aa  818    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  61.92 
 
 		 791 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  64.25 
 
 		 791 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  62.19 
 
 		 777 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  62.32 
 
 		 791 aa  568  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  66.26 
 
 		 413 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 844 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  62.29 
 
 		 810 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  39.19 
 
 		 775 aa  308  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  44.35 
 
 		 389 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  39.22 
 
 		 345 aa  276  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  39.75 
 
 		 343 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  39.47 
 
 		 359 aa  272  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  41.28 
 
 		 358 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  39.51 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  31.57 
 
 		 313 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  30.98 
 
 		 324 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  32.04 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  31.23 
 
 		 318 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  30.81 
 
 		 315 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  30.17 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  30.84 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  31.22 
 
 		 416 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  31.22 
 
 		 416 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  30.99 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  30.81 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  33.74 
 
 		 418 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 320 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  30.07 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  29.3 
 
 		 363 aa  136  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  30.15 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  28.71 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  27.78 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  28.23 
 
 		 321 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  28.78 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  28.61 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  29.64 
 
 		 379 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  29.51 
 
 		 443 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  29.47 
 
 		 438 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  29.47 
 
 		 438 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  29.5 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  37.93 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  27.5 
 
 		 484 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  29.95 
 
 		 312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  29.95 
 
 		 312 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  28.19 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  28.57 
 
 		 314 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.67 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  26.39 
 
 		 360 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  33.8 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  28.03 
 
 		 479 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  35.64 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  35.82 
 
 		 313 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  34.15 
 
 		 381 aa  103  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  35.68 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  35.68 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  35.29 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  34.16 
 
 		 314 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  27.24 
 
 		 342 aa  97.1  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  30.67 
 
 		 303 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  25.12 
 
 		 303 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  27.02 
 
 		 329 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  28.66 
 
 		 329 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  25.86 
 
 		 303 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  27.64 
 
 		 305 aa  94  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  28.66 
 
 		 332 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  28.4 
 
 		 318 aa  93.2  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  27.9 
 
 		 328 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  26.79 
 
 		 329 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  25.78 
 
 		 329 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.35 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  25.55 
 
 		 330 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  26.15 
 
 		 339 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  26.85 
 
 		 337 aa  90.9  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  28.39 
 
 		 291 aa  90.1  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  28.44 
 
 		 337 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  27.69 
 
 		 340 aa  89  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  25 
 
 		 299 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  26.23 
 
 		 350 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  24.55 
 
 		 498 aa  87.4  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  33.5 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  26.48 
 
 		 285 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  26.25 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  26.17 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  26.15 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  28.21 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  27.27 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  30.12 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  25 
 
 		 310 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  27.27 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  26.14 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  26.14 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  26.14 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  25.61 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>