More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1734 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
422 aa  860    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0848  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.18 
 
 
421 aa  477  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1019  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.14 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00940822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0540  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.69 
 
 
431 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0914716  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0363  hypothetical protein  44.94 
 
 
421 aa  330  4e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  40.1 
 
 
423 aa  263  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  38.93 
 
 
468 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  39.86 
 
 
440 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  41.09 
 
 
488 aa  249  6e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  37.05 
 
 
432 aa  242  9e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  34.1 
 
 
455 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.51 
 
 
399 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  32.7 
 
 
437 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  32.7 
 
 
437 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  34.35 
 
 
440 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  35.57 
 
 
446 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  36.3 
 
 
446 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  36.92 
 
 
446 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  34.42 
 
 
442 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  35.6 
 
 
445 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  34.98 
 
 
441 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  33.98 
 
 
444 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.33 
 
 
445 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  32.37 
 
 
439 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  33.5 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.4 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  28.29 
 
 
418 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  35.13 
 
 
445 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  34.36 
 
 
444 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.57 
 
 
431 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.4 
 
 
418 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  32.55 
 
 
444 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  33.92 
 
 
444 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  32.17 
 
 
444 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  32.17 
 
 
444 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  32.6 
 
 
442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  32.13 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  33.72 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  33.17 
 
 
454 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  31.6 
 
 
441 aa  166  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  32.64 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  32.85 
 
 
464 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  31.21 
 
 
443 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  31.28 
 
 
439 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  31.73 
 
 
445 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  31.17 
 
 
444 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.47 
 
 
446 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  30.65 
 
 
469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.03 
 
 
420 aa  156  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  32.72 
 
 
456 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.36 
 
 
457 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.39 
 
 
458 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  31.87 
 
 
422 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  33.07 
 
 
465 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  32.15 
 
 
456 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  32.15 
 
 
456 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.34 
 
 
431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.07 
 
 
425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31 
 
 
494 aa  153  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  33.49 
 
 
427 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.41 
 
 
425 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.23 
 
 
426 aa  152  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  31.51 
 
 
444 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1961  dihydroorotase  30.73 
 
 
383 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  29.02 
 
 
423 aa  149  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.59 
 
 
424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  31.48 
 
 
427 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.18 
 
 
424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  29.93 
 
 
443 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.88 
 
 
425 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  29.85 
 
 
425 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  29.93 
 
 
443 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  32.08 
 
 
439 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.2 
 
 
425 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.33 
 
 
429 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.98 
 
 
441 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  29.36 
 
 
426 aa  144  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  31.65 
 
 
427 aa  143  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  31.71 
 
 
436 aa  143  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.46 
 
 
418 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.5 
 
 
428 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1675  amidohydrolase  28.29 
 
 
384 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.717756  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  32.93 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  30.41 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.12 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  32.32 
 
 
428 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  28.61 
 
 
426 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  27.75 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  28.3 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  29.88 
 
 
430 aa  140  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.05 
 
 
425 aa  139  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  30.22 
 
 
431 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  30.37 
 
 
431 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  32.22 
 
 
432 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  31.43 
 
 
433 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  30.45 
 
 
445 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  32.78 
 
 
442 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.61 
 
 
429 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  33.42 
 
 
435 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.83 
 
 
442 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>