More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8116 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 187 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  60.75 
 
 		 190 aa  254  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  61.2 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  61.2 
 
 		 185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  59.56 
 
 		 195 aa  241  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  61.59 
 
 		 165 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  54.19 
 
 		 190 aa  227  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  55.62 
 
 		 190 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  55.06 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  55.56 
 
 		 162 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  43.48 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  33.55 
 
 		 156 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  32.28 
 
 		 156 aa  99  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  35.67 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  34.34 
 
 		 300 aa  93.2  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  32.67 
 
 		 155 aa  91.7  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  35.67 
 
 		 158 aa  91.3  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  33.12 
 
 		 266 aa  90.5  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  32.3 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  44.44 
 
 		 162 aa  84.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  45 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  34 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  32.75 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  31.71 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  29.94 
 
 		 262 aa  81.3  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  30.67 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  39.53 
 
 		 405 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  25.15 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  31.87 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  41.03 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  36.14 
 
 		 271 aa  62  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  38.1 
 
 		 287 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 		 344 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  35.96 
 
 		 260 aa  61.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  32.04 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  24.18 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  39.47 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.53 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  30.77 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  27.94 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  26.98 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  32.94 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  33.01 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 		 401 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 		 401 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  32.93 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  27.83 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  25.62 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  26.98 
 
 		 370 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1910  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 334 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  26.92 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 392 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 318 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  29.36 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  40.54 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  29.73 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  28.26 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  34.44 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  29.71 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.32 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  25.21 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  31.82 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  35.37 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  37.08 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  27.63 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 350 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  27.1 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  25.89 
 
 		 362 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  36.67 
 
 		 408 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 402 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 378 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  28.18 
 
 		 511 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  24.81 
 
 		 279 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  25.89 
 
 		 362 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  25.14 
 
 		 374 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  27.1 
 
 		 342 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 		 389 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  34.12 
 
 		 426 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 		 389 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  28.12 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  32.93 
 
 		 257 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.79 
 
 		 274 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  27.59 
 
 		 398 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 		 405 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  28.04 
 
 		 330 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.33 
 
 		 316 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 401 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  29.89 
 
 		 276 aa  52.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  26.43 
 
 		 269 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  37.36 
 
 		 275 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 		 389 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  26.74 
 
 		 345 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>