More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7401 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  94.76 
 
 		 248 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  85.83 
 
 		 248 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  85.37 
 
 		 248 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  85.37 
 
 		 264 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  86.59 
 
 		 248 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  76.02 
 
 		 248 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  75.2 
 
 		 248 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  73.58 
 
 		 248 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  72.36 
 
 		 248 aa  384  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  71.95 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  74.39 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  71.14 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  75.2 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  69.11 
 
 		 248 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  71.77 
 
 		 248 aa  354  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  76.52 
 
 		 249 aa  353  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  68.7 
 
 		 249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  66.67 
 
 		 248 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  66.67 
 
 		 248 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  65.04 
 
 		 248 aa  343  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  65.04 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  65.04 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  63.82 
 
 		 248 aa  338  2.9999999999999998e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  64.23 
 
 		 248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  63.82 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  60.98 
 
 		 246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  60.98 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  59.35 
 
 		 246 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  62.2 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  56.86 
 
 		 255 aa  297  9e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  59.92 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  58.7 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  59.51 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  54.94 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  59.35 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  54.37 
 
 		 253 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  59.51 
 
 		 249 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  57.2 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  54.07 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  50.61 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  50.61 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  52.23 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  52.02 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  47.18 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  49.39 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  50.2 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  49.39 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  46.5 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  48.41 
 
 		 255 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  47.54 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  49.19 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  47.18 
 
 		 249 aa  228  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  48.99 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  51.05 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  46.37 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  54 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  49.21 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  50.8 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.37 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0351  hypothetical protein  45.71 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.37 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  49.58 
 
 		 243 aa  222  4e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  46.12 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2054  hypothetical protein  46.61 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2028  hypothetical protein  46.61 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  47.2 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  46.37 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  44.58 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  46.37 
 
 		 248 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  49.79 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  49.37 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  47.6 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  45.16 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  47.6 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4347  hypothetical protein  47.04 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  48.59 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  43.15 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  46.8 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  47.2 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  47.2 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  45.97 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  47.06 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  45.56 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  45.97 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>