More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4587 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3027  ABC transporter related  87.5 
 
 		 572 aa  936    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344484  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4587  ABC transporter related  100 
 
 		 587 aa  1135    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2996  ABC transporter related  61.14 
 
 		 596 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.637483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2874  ABC transporter related  62.48 
 
 		 597 aa  609  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3100  ABC transporter related  62.48 
 
 		 597 aa  609  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.87066  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5589  ABC transporter related  61.96 
 
 		 586 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0588  ABC transporter related  45.21 
 
 		 579 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3016  ABC transporter related  43.53 
 
 		 605 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  41.17 
 
 		 588 aa  379  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  37.76 
 
 		 627 aa  361  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.86 
 
 		 585 aa  342  9e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  40 
 
 		 605 aa  342  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3561  ABC transporter, transmembrane region  43.71 
 
 		 579 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  41.62 
 
 		 611 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.89 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.1 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  37.01 
 
 		 579 aa  325  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  39.07 
 
 		 611 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  38.88 
 
 		 611 aa  324  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  38.72 
 
 		 590 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  37.55 
 
 		 624 aa  323  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4538  ABC transporter related  39.54 
 
 		 596 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232749 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  38.35 
 
 		 590 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.17 
 
 		 590 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.88 
 
 		 611 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.02 
 
 		 580 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.45 
 
 		 602 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.53 
 
 		 596 aa  312  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.76 
 
 		 572 aa  310  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  35.71 
 
 		 609 aa  310  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  36.35 
 
 		 595 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.96 
 
 		 609 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.96 
 
 		 591 aa  309  8e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  36.41 
 
 		 579 aa  306  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  36.17 
 
 		 595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.13 
 
 		 580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  31.86 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  33.16 
 
 		 618 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1984  ABC transporter related  36.77 
 
 		 619 aa  300  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.434554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.32 
 
 		 571 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.97 
 
 		 579 aa  296  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4230  ABC transporter related  34.6 
 
 		 621 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  34.39 
 
 		 589 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  35.44 
 
 		 600 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.58 
 
 		 583 aa  293  8e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.17 
 
 		 583 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1426  ABC transporter related  36.14 
 
 		 600 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  32.72 
 
 		 588 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  38.01 
 
 		 600 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34 
 
 		 574 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34 
 
 		 574 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.59 
 
 		 597 aa  286  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.98 
 
 		 587 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  35.01 
 
 		 601 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  33.72 
 
 		 612 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  37.08 
 
 		 602 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.59 
 
 		 613 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1596  ABC transporter related  38.4 
 
 		 600 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  33.82 
 
 		 592 aa  282  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  33.89 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.72 
 
 		 600 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  35.2 
 
 		 601 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.89 
 
 		 581 aa  280  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5675  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.2 
 
 		 601 aa  280  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400511  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.99 
 
 		 579 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  35.3 
 
 		 1522 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  31.43 
 
 		 566 aa  277  4e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.88 
 
 		 606 aa  276  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  32.22 
 
 		 613 aa  276  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.87 
 
 		 556 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.51 
 
 		 584 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1292  ABC transporter related  35.04 
 
 		 601 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.57 
 
 		 590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  34.58 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  36.76 
 
 		 567 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  33.6 
 
 		 585 aa  274  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.8 
 
 		 590 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.76 
 
 		 567 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  33.51 
 
 		 601 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.28 
 
 		 584 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  34.45 
 
 		 578 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.48 
 
 		 587 aa  273  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  34.55 
 
 		 610 aa  273  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  43.44 
 
 		 612 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  43.72 
 
 		 612 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  32.06 
 
 		 580 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1062  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.21 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.49 
 
 		 589 aa  271  4e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0154  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.14 
 
 		 585 aa  270  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  34.22 
 
 		 603 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.48 
 
 		 603 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1316  lipid/multidrug ABC transporter MsbA ATPase and inner membrane domains  32.21 
 
 		 595 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.93 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  38.93 
 
 		 652 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.52 
 
 		 594 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3812  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.26 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  34.79 
 
 		 594 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.13 
 
 		 610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  33.27 
 
 		 575 aa  267  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.45 
 
 		 586 aa  267  5e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>