More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2877 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  54.3 
 
 
1032 aa  1016    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  51.57 
 
 
1028 aa  926    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  71.37 
 
 
1064 aa  1333    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  38.21 
 
 
1050 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  35.95 
 
 
1071 aa  641    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1061 aa  2056    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  70.96 
 
 
1064 aa  1334    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  71.51 
 
 
1064 aa  1354    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  69.05 
 
 
1052 aa  1387    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  53.13 
 
 
1039 aa  962    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  93.11 
 
 
1054 aa  1830    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  51.16 
 
 
1046 aa  951    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  39.04 
 
 
1054 aa  687    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  69.8 
 
 
1055 aa  1235    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.37 
 
 
1061 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  37.4 
 
 
1066 aa  628  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  38.04 
 
 
1041 aa  624  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.74 
 
 
1066 aa  622  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  38.31 
 
 
1045 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  36.71 
 
 
1039 aa  607  9.999999999999999e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.46 
 
 
1053 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  42.03 
 
 
1033 aa  595  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.77 
 
 
1054 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.54 
 
 
1037 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  37.32 
 
 
1034 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  36.98 
 
 
1023 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.51 
 
 
1048 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.09 
 
 
1049 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  36.79 
 
 
1036 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.54 
 
 
1037 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.71 
 
 
1034 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  37.65 
 
 
1043 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  38.83 
 
 
1043 aa  576  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.11 
 
 
1092 aa  570  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.24 
 
 
1049 aa  568  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 
1031 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  37.43 
 
 
1049 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.09 
 
 
1049 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  37.04 
 
 
1040 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  42.83 
 
 
1034 aa  552  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  35.59 
 
 
1057 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  36.84 
 
 
1075 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.46 
 
 
1026 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.35 
 
 
1039 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  34.97 
 
 
1039 aa  543  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  36.11 
 
 
1047 aa  545  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  35.62 
 
 
1044 aa  544  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  37.26 
 
 
1047 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.48 
 
 
1039 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.48 
 
 
1039 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  34.8 
 
 
1039 aa  535  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  37.09 
 
 
1066 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  37.25 
 
 
1058 aa  532  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.28 
 
 
1039 aa  532  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  37.18 
 
 
1058 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  35.59 
 
 
1043 aa  528  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.92 
 
 
1039 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  34.22 
 
 
1039 aa  526  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  32.45 
 
 
1052 aa  519  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.94 
 
 
1048 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.98 
 
 
1034 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  33.56 
 
 
1033 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.67 
 
 
1020 aa  484  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  32.77 
 
 
1065 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  38.56 
 
 
1030 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  33.04 
 
 
1032 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  33.01 
 
 
1046 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  34.43 
 
 
1066 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  33.99 
 
 
1029 aa  472  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  33 
 
 
1032 aa  469  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.01 
 
 
1047 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  31.27 
 
 
1034 aa  465  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  32.75 
 
 
1064 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  32.4 
 
 
1031 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  31.98 
 
 
1032 aa  459  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  31.25 
 
 
1049 aa  459  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.54 
 
 
1049 aa  458  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  31.37 
 
 
1043 aa  458  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  31.01 
 
 
1066 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  33.56 
 
 
1045 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  31.76 
 
 
1034 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  32.88 
 
 
1040 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.78 
 
 
1034 aa  452  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  32.5 
 
 
1070 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
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NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  32.04 
 
 
1069 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.44 
 
 
1052 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  32.73 
 
 
1077 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  32.73 
 
 
1077 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  32.31 
 
 
1070 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  32.73 
 
 
1077 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  31.92 
 
 
1051 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.63 
 
 
1034 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  32.41 
 
 
1070 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
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NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  32.41 
 
 
1070 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  32.73 
 
 
1077 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  32.53 
 
 
1048 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  32.41 
 
 
1070 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324532 
 
 
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NC_006369  lpl1046  HelA protein  30.41 
 
 
1052 aa  445  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  30.62 
 
 
1064 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  32.31 
 
 
1082 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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