More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0073 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  67.48 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  58.26 
 
 		 196 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  57.39 
 
 		 177 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  55.26 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  55.26 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  52.34 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  54.39 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  55.26 
 
 		 194 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  60.17 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  50.86 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  53.51 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  51.94 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  55.17 
 
 		 198 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  51.3 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  43.65 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  38.1 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  35.04 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  40.18 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  36.04 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  37.61 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  32.11 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 696 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  34.48 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 688 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  41.86 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  37.86 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  28.95 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  42.22 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  29.2 
 
 		 368 aa  60.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 548 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0438  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 1067 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  34.21 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  30.09 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  36.89 
 
 		 573 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2991  response regulator receiver protein  34 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 661 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 926 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  33.33 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  36.54 
 
 		 726 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 650 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 796 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 793 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 209 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 740 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  34.62 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 1132 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 727 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 903 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 888 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 630 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1415 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  36 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1036 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 600 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  31.97 
 
 		 892 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 741 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 727 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  37 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 882 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 732 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>