More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3057 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3057  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  627  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4833  LysR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1932  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.795465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3148  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 309 aa  255  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.774562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5485  transcriptional regulator LysR family  43.89 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.781611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0866  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6227  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0163  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3196  nodulation protein d1  37.88 
 
 		 312 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4024  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.715762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1227  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6183  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3833  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7723  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 304 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.262185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3434  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1535  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  hitchhiker  0.00238453 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5941  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0853  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255595  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4915  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6212  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 319 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0846  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5026  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5035  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.776496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3538  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  29.14 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3423  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0556291  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2305  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.15 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3550  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.21 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  29.43 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2387  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  28.75 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5845  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5015  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  28.29 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4334  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106421  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0693  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3034  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0386168  normal  0.816732 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5082  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  27.33 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3222  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>