More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2452 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2452  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  617  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0659  LysR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  45.7 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5126  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5497  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315237  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4986  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.910518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.85 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5280  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1704  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4657  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3711  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5630  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0341867 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5847  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5647  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.287338 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6370  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3380  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.846396 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2980  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3105  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1328  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2287  nitrogen assimilation regulatory protein Nac, putative  31.58 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4825  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.861271  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4729  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417319  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1646  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6698  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1293  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00171024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1568  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_003296  RS02127  transcriptional regulator transcription regulator protein  25.82 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1879  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0397318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.85 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4299  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.64 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.941417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  26 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2256  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 333 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1111  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3790  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.98544 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1591  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0175342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1487  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235813  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1507  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6176  transcriptional regulator, LysR family  23.84 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.99 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0178  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1590  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1297  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3263  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266954  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5425  Transcriptional regulator  30.64 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2943  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0513  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3069  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227283  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4492  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.957194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3825  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.363475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1722  LysR substrate-binding  30.53 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0793479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4735  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2041  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1765  transcriptional regulator, LysR family  25.78 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1817  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  hitchhiker  0.00360584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1092  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0509948  normal  0.0429857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4153  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5122  transcriptional regulator, LysR family  26.06 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4202  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3921  transcriptional regulator, LysR family  25.93 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4035  transcriptional regulator, LysR family  25.93 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.176512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0963  LysR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5567  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2268  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.84 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170931  normal  0.112201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3236  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5640  transcriptional regulator LysR family  27.05 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5409  LysR family protein  28.24 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3652  transcriptional regulator, LysR family  27.93 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4382  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3548  transcriptional regulator LysR family  27.24 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4629  transcriptional regulator, LysR family  25.4 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2072  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  26.53 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0778  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2577  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.216536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1679  transcriptional regulator, LysR family  27.63 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409194  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2416  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  23.79 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000387203  decreased coverage  0.000000509864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1185  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000537468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1264  LysR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2975  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819316  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1720  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4662  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1340  LysR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875316  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2518  LysR family regulatory protein  24.74 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3757  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02870  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 316 aa  95.5  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1272  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0223  transcriptional regulator, LysR family  24.83 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1239  transcriptional regulator, LysR family  29.34 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138802  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0319  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>