101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1903 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1903  LppZ  100 
 
 		 391 aa  782    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1949  LppZ  100 
 
 		 391 aa  782    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1883  LppZ  100 
 
 		 391 aa  782    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24433  normal  0.198327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4242  LppZ  84.48 
 
 		 362 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2119  LppZ  85.63 
 
 		 363 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13021  lipoprotein lppZ  76.9 
 
 		 394 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3234  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.33 
 
 		 365 aa  239  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2868  hypothetical protein  41.78 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08770  hypothetical protein  38.12 
 
 		 385 aa  193  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6029  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.28 
 
 		 385 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  35.82 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.71 
 
 		 407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  30.13 
 
 		 369 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  31.61 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  33.65 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  30.57 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  41.86 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  33.18 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  38.89 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  29.97 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  29.67 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  37.93 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.14 
 
 		 809 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  26.98 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  32.03 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  32.11 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  27.62 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  32.03 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.1 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  37.91 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  32.58 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  34.51 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.87 
 
 		 729 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.54 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  31.14 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  27.33 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.23 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  35.25 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  27.43 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  33.57 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  26.79 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  36.08 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  26.85 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  27.96 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  26.73 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  28 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  26.07 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  26.64 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  25.24 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  25.24 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  27.61 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  21.97 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  25.24 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  25.24 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  25.24 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  25.24 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  24.29 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  25.24 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  27.59 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  28.32 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  31.52 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  29.85 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  25.73 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  24.4 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  25.31 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  24.31 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  26.92 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  37.38 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  23.79 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  28.83 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2516  glucose sorbosone dehydrogenase  26.17 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.461301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  25.24 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  23.83 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  24.86 
 
 		 360 aa  47  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  27.98 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  25.56 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  27.78 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  24.42 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  25.6 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  27.04 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  26.46 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  29.81 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  29.81 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  21.33 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  29.91 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  29.56 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4543  glucose sorbosone dehydrogenase  29.11 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  27.85 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1990  hypothetical protein  26.75 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  29.82 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  24 
 
 		 466 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>