62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3258 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  100 
 
 		 2454 aa  4858    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  28.74 
 
 		 3544 aa  217  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.52 
 
 		 3699 aa  209  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  27.64 
 
 		 3699 aa  192  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.97 
 
 		 5787 aa  119  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  26.89 
 
 		 2656 aa  97.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.32 
 
 		 1779 aa  95.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.36 
 
 		 2522 aa  89  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  34.25 
 
 		 3193 aa  88.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.11 
 
 		 11716 aa  85.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0304  hypothetical protein  36.57 
 
 		 542 aa  81.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  28.03 
 
 		 2853 aa  75.9  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  33.15 
 
 		 410 aa  71.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  29.48 
 
 		 322 aa  69.7  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  32.09 
 
 		 153 aa  68.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.51 
 
 		 2507 aa  65.9  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.73 
 
 		 3927 aa  65.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.66 
 
 		 1063 aa  64.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  25.95 
 
 		 2890 aa  63.5  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0927  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1248 aa  63.5  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0959972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.96 
 
 		 1372 aa  63.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  32.06 
 
 		 164 aa  62.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  32.62 
 
 		 942 aa  62  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  32.23 
 
 		 932 aa  60.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.88 
 
 		 1152 aa  60.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  26.75 
 
 		 4687 aa  59.3  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  29.7 
 
 		 928 aa  58.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  26.22 
 
 		 4285 aa  58.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  33.1 
 
 		 928 aa  58.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0811  hypothetical protein  33.66 
 
 		 800 aa  57.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  28.81 
 
 		 146 aa  57.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  30.51 
 
 		 282 aa  57.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1405  hypothetical protein  34.78 
 
 		 155 aa  55.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  24.72 
 
 		 4231 aa  55.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2086  hypothetical protein  32.2 
 
 		 155 aa  55.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  37.07 
 
 		 2145 aa  55.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  27.27 
 
 		 1323 aa  53.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  27.7 
 
 		 3121 aa  54.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  33.33 
 
 		 938 aa  53.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  25.65 
 
 		 5020 aa  53.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3718  hypothetical protein  28.1 
 
 		 154 aa  52.8  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.98166  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  28.31 
 
 		 2039 aa  52  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  26.98 
 
 		 1166 aa  52.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  26.87 
 
 		 143 aa  51.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  28.01 
 
 		 1565 aa  51.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  22.86 
 
 		 380 aa  50.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  31.37 
 
 		 235 aa  50.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  23.11 
 
 		 795 aa  50.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  29.74 
 
 		 341 aa  48.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  24.94 
 
 		 3474 aa  49.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2038  hypothetical protein  24.63 
 
 		 424 aa  47.8  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  22.38 
 
 		 678 aa  47.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  26.98 
 
 		 143 aa  47.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.28 
 
 		 802 aa  47  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  35.96 
 
 		 2820 aa  47.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  35.9 
 
 		 674 aa  47.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  30.63 
 
 		 2636 aa  47  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0788  chemotaxis sensory transducer  20.41 
 
 		 529 aa  46.6  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  25.26 
 
 		 2337 aa  46.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  24.03 
 
 		 147 aa  46.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 516 aa  46.2  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  28.72 
 
 		 312 aa  45.8  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>