32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2038 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2038  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  835    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3782  hypothetical protein  77.7 
 
 		 427 aa  633  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0215  hypothetical protein  62.38 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0075  hypothetical protein  58.87 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5031  hypothetical protein  60.37 
 
 		 429 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3844  hypothetical protein  57.45 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1240  hypothetical protein  61.88 
 
 		 373 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3667  hypothetical protein  36.01 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4622  hypothetical protein  35.51 
 
 		 427 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0984067  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0810  hypothetical protein  33.89 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.450198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0462  hypothetical protein  35.5 
 
 		 409 aa  202  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0050  hypothetical protein  30.09 
 
 		 449 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0035  hypothetical protein  30.09 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0074  hypothetical protein  30.09 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.477349  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1755  hypothetical protein  29.54 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1783  hypothetical protein  29.3 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0034  hypothetical protein  28.18 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.907234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4361  hypothetical protein  28.8 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1067  hypothetical protein  26.69 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0966  hypothetical protein  26.14 
 
 		 457 aa  53.9  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07871  hypothetical protein  24.72 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0459178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1676  hypothetical protein  25.68 
 
 		 469 aa  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.729068 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl427  chromosome segregation ATPase  21.08 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000465666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07871  hypothetical protein  26.18 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11011  hypothetical protein  24.48 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0193058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1799  hypothetical protein  25.91 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08551  hypothetical protein  23.28 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.219552  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06331  hypothetical protein  29.53 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.13594  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0409  hypothetical protein  24.78 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.809492  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1000  hypothetical protein  22.52 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0413832  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0737  hypothetical protein  25.15 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00875447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>