More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0423 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  685    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35070  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  31.43 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2960  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  25.84 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  28.16 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0411  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  20.48 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2545  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  22.71 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  31.69 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0866  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.24 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  24.67 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0422  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  24.82 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4523  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.027207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0360  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  25.69 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  33.05 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  23.13 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  33.9 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  30.94 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  33.03 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>