More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0411 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0411  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  716    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2545  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  30.5 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  31.53 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  24.19 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3661  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 398 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 259 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  32.99 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  32 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  30.17 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  30.17 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  30.17 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  30.17 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2921  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28660  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.48 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4693  helix-turn-helix domain-containing protein  37.66 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3518  cyclic nucleotide-binding  34.67 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  26.36 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  32.32 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0706  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0374737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3754  transcriptional activator RhaS  40.51 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0740  transcriptional activator RhaS  40.51 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0791489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3842  transcriptional activator RhaS  40.51 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  36.25 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1572  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  33.73 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 162 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3035  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.71 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1433  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000646594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  32.14 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23720  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.04 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 548 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>