262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1747 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1747  signal transduction protein  100 
 
 
126 aa  252  9e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0715  signal transduction protein  94.44 
 
 
128 aa  239  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0155  signal transduction protein  90.48 
 
 
126 aa  233  9e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.383666  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0013  signal transduction protein  65.08 
 
 
127 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.636073  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0729  signal transduction protein  48.84 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0315509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 
215 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 
250 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  30.08 
 
 
214 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  32.09 
 
 
220 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  28.03 
 
 
211 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  28.46 
 
 
269 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  28.15 
 
 
222 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  29.27 
 
 
300 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  30.08 
 
 
300 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  28.57 
 
 
214 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  24.63 
 
 
256 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  27.07 
 
 
221 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 
225 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  26.92 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  27.69 
 
 
209 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  25.81 
 
 
589 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 
225 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 
211 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 
221 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  22.45 
 
 
282 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  28.81 
 
 
502 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  28.28 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  24.81 
 
 
223 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  26.28 
 
 
302 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  25.83 
 
 
145 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.92 
 
 
877 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  28.33 
 
 
262 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  32.58 
 
 
637 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  24.81 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
211 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  24.59 
 
 
586 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  24.8 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  27.07 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1169  CBS domain-containing protein  25.4 
 
 
214 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.137259  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.54 
 
 
426 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  25 
 
 
230 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  26.56 
 
 
279 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  28.46 
 
 
287 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  22.76 
 
 
867 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  24.24 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  28.46 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  29.41 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  28.24 
 
 
291 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  28.36 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  28.91 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  24.06 
 
 
212 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  28.68 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  25.81 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  27.2 
 
 
620 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  31.65 
 
 
295 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 
219 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  24.81 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  25 
 
 
227 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  37.04 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  26.67 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  22.48 
 
 
261 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  26.19 
 
 
208 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  37.04 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  26.81 
 
 
398 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  24.81 
 
 
211 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  21.6 
 
 
258 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  26.83 
 
 
375 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  30 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  28.24 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  29.75 
 
 
880 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  27.27 
 
 
614 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  28.03 
 
 
230 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  32.54 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  25.98 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 
615 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  27.2 
 
 
620 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  25.21 
 
 
625 aa  47.4  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.81 
 
 
145 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  26.72 
 
 
137 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  27.64 
 
 
290 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  26.67 
 
 
212 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 
232 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  29.27 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  23.77 
 
 
606 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  24.24 
 
 
320 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  24.22 
 
 
208 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  24.5 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  26.4 
 
 
620 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  26.4 
 
 
620 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  32.03 
 
 
626 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  27.27 
 
 
615 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>