230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1746 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 160 aa  312  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  92.5 
 
 		 160 aa  296  8e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  93.75 
 
 		 160 aa  295  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  63.69 
 
 		 159 aa  208  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  37.24 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  37.24 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  32.68 
 
 		 160 aa  97.1  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  33.1 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  36.43 
 
 		 416 aa  88.2  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  38.64 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  33.58 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  36.88 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  35.38 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  36.11 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  35.34 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  30.77 
 
 		 191 aa  70.5  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  35.88 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  33.85 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  35.94 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  30.92 
 
 		 214 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1619  SNARE associated Golgi protein  28.37 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0146715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  34.81 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  32.81 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  32.56 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  34.85 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  29.93 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  32.56 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.43 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  31.52 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  34.56 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  30.23 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  27.97 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  28.68 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  31.3 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  31.3 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  31.29 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  31.3 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  29.1 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.9 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  29.55 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  27.13 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  28.12 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 		 237 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  30.63 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  27.85 
 
 		 211 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  32.05 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  30.61 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  23.29 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  23.29 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  29.38 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.32 
 
 		 198 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  29.92 
 
 		 194 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  29.92 
 
 		 212 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  28.08 
 
 		 193 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  29.08 
 
 		 204 aa  50.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.67 
 
 		 251 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0048  hypothetical protein  27.7 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  29.07 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  30.23 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  28.29 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  27.7 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  30.94 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.33 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  27.91 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.08 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0045  hypothetical protein  28.38 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0015548  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  31.87 
 
 		 220 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  31.87 
 
 		 220 aa  48.5  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  31.87 
 
 		 220 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  31.94 
 
 		 202 aa  48.5  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  28.71 
 
 		 231 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  30.07 
 
 		 720 aa  48.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  29.34 
 
 		 248 aa  47.8  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  28.29 
 
 		 212 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  31.39 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  27.85 
 
 		 268 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  28.46 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  31.76 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  30.28 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1381  membrane protein-like protein  24.44 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0395  SNARE associated Golgi protein  31.11 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  30.72 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  27.03 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4843  dedA family protein  31.11 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.19 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  29.11 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  27.54 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0480  dedA family protein  31.11 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  26.09 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  29.81 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  30.19 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  28.4 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  27.08 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>