167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0801 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  92 
 
 
350 aa  662    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  92.57 
 
 
350 aa  663    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  100 
 
 
351 aa  714    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  69.14 
 
 
364 aa  502  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  48.25 
 
 
367 aa  322  8e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  33.24 
 
 
355 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  28.85 
 
 
344 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  30.84 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  30.14 
 
 
346 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  33.21 
 
 
317 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  32.73 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  32.83 
 
 
322 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  31.64 
 
 
318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  29.8 
 
 
317 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  27.21 
 
 
334 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  28.11 
 
 
343 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  32.1 
 
 
315 aa  103  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  26.32 
 
 
365 aa  102  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  27.4 
 
 
356 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  24.92 
 
 
371 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  32.43 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  30.91 
 
 
304 aa  85.9  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  27.19 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  33.75 
 
 
224 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  31.25 
 
 
591 aa  70.1  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  25.39 
 
 
469 aa  67  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  28.05 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  28.15 
 
 
356 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  24.14 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  24.55 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  33.62 
 
 
437 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  30.83 
 
 
499 aa  63.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  29.94 
 
 
225 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  27.5 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  36.99 
 
 
259 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  24.87 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  26.44 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  27.12 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  24.56 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  26.44 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  26.44 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  26.44 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  28.03 
 
 
292 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  26.55 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  26.55 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  24.48 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  24.48 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  26.46 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  26.37 
 
 
405 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46959  predicted protein  25.94 
 
 
460 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897224  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  28.44 
 
 
281 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  24.08 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  30.3 
 
 
350 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  22.66 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.52 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 
947 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  35.58 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  26.4 
 
 
475 aa  50.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.33 
 
 
375 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  25.09 
 
 
379 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.11 
 
 
499 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  24.46 
 
 
425 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  26.95 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.69 
 
 
524 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  26.04 
 
 
209 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  28.43 
 
 
675 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  28.93 
 
 
480 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  26.28 
 
 
493 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  35.29 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  23.59 
 
 
430 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  27.16 
 
 
227 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  28.46 
 
 
201 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  25.32 
 
 
709 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  24.87 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  41.18 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  25.37 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  36.9 
 
 
389 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  28.05 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  23.59 
 
 
430 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  23.59 
 
 
430 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1331  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.33 
 
 
293 aa  47  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  23.59 
 
 
430 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  23.59 
 
 
430 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  23.59 
 
 
430 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  23.59 
 
 
430 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  27.5 
 
 
349 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  24.35 
 
 
381 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  24.35 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  28.18 
 
 
305 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  23.59 
 
 
430 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  29.52 
 
 
299 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  29.52 
 
 
299 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  41.07 
 
 
463 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>