More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1294 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  70 
 
 		 153 aa  186  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 151 aa  186  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 171 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  38.55 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0281  regulatory protein MarR  30.17 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  48 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2306  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000137668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  36.11 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0812  transcriptional regulator Hpr  46.67 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.116423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.12 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0960  transcriptional regulator Hpr  45 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>