More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0471 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  100 
 
 		 312 aa  628  1e-179  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  95.51 
 
 		 312 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  94.87 
 
 		 312 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  83.12 
 
 		 312 aa  536  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  74.43 
 
 		 314 aa  490  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  56.86 
 
 		 310 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  57.19 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  56.52 
 
 		 310 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  53.9 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  57.67 
 
 		 314 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  57.67 
 
 		 314 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  54.49 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  55.85 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  53.44 
 
 		 306 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  51.28 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  51.6 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  53.9 
 
 		 315 aa  316  4e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  55.96 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  53.72 
 
 		 311 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  58.22 
 
 		 314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  48.68 
 
 		 321 aa  301  7.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  56.19 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  51.33 
 
 		 311 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  53.38 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  48.04 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  47.27 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  49.67 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  47.23 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  47.23 
 
 		 315 aa  282  7.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  46.13 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  46.77 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  54.28 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  48.5 
 
 		 320 aa  278  9e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  46.79 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  46.45 
 
 		 326 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  47.59 
 
 		 320 aa  275  9e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  46.38 
 
 		 317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  49.03 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  45.16 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  46.28 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  46.73 
 
 		 317 aa  269  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  43.87 
 
 		 327 aa  268  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  44.63 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  50 
 
 		 318 aa  267  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  43.87 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  46.18 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  44.87 
 
 		 319 aa  262  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  47.04 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  46.84 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  43.46 
 
 		 321 aa  245  6.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  43.19 
 
 		 319 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  41.78 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  42.56 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  39.41 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  39.8 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  38.46 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  40.13 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  39.05 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  41.31 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  38.13 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  39.8 
 
 		 314 aa  219  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  38.61 
 
 		 342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  38.92 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  36.45 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  38.13 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  36.81 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  40.45 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  38.13 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  39.13 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  38.44 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  41.64 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  39.94 
 
 		 592 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  38.92 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  39.13 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  36.6 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  37.82 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  36.12 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  34.3 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  37.21 
 
 		 342 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  38.26 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  35.45 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  36.79 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  39.1 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  37.46 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0727  transketolase central region  37.04 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  34.78 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  36.18 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  38.67 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  36.03 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  37.97 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  35.23 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  40.53 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  40.48 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  35.84 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  36.68 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  35.84 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  36.33 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  36.33 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  37.12 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  36.21 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>