More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0284 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0284  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0044602  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  57.53 
 
 		 192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  54.89 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  53.23 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  53.23 
 
 		 191 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3335  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.34 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 		 204 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.92 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  47.78 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  48.63 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.17 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  48.88 
 
 		 201 aa  167  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  45.79 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  46.28 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  46.84 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  48.85 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  46.52 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3743  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.02 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  45.79 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  48.07 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  47.75 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  47.75 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  46.84 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  48.07 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  48.07 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  48.07 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  45.26 
 
 		 216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  45.26 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  48.07 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1984  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.76 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.440019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  47.19 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  46.41 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2260  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.92 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.94 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  47.54 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  45.26 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  45.26 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.74 
 
 		 213 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  46.03 
 
 		 202 aa  160  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  46.89 
 
 		 722 aa  159  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  43.92 
 
 		 215 aa  158  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  42.93 
 
 		 214 aa  158  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  44.68 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  44.68 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  43.98 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  44.21 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  46.67 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.63 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  42.93 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.35 
 
 		 215 aa  156  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  45.36 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  45.9 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.9 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  45.9 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  46.11 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  45.9 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  45.9 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  45.56 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  41.05 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  46.41 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  44.51 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  43.16 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  43.62 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  45.56 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  45.36 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  44.21 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  44.21 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  45.9 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  45.9 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.51 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  41.62 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  45.51 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  44.81 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  47.13 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  44.21 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  45 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  46.55 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  43.33 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  43.08 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  43.68 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.13 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  43.32 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>