80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0514 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  39.72 
 
 
255 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  27.04 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  29.55 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  27 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  29.78 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  28.21 
 
 
291 aa  95.9  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  27.59 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  33.12 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  26.39 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  27.23 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  28.37 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  28.37 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  28.37 
 
 
291 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  34.44 
 
 
236 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  32.48 
 
 
237 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  34.44 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  28.37 
 
 
291 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  33.77 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  33.77 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  32.28 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  32.28 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  26.05 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  29.44 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  26.51 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  25.63 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  28.57 
 
 
296 aa  79  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  25.63 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  29.63 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  35.37 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  25.51 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  28.04 
 
 
223 aa  72  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  28.7 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  29.89 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  28.7 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  29.02 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  26.09 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  24.58 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.57 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  24.49 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  23.64 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1496  hypothetical protein  30.83 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  33.71 
 
 
238 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  30.13 
 
 
435 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  26.28 
 
 
460 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  30.13 
 
 
433 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  25.27 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  25.45 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  23.94 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  26.92 
 
 
418 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  27.56 
 
 
435 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  25 
 
 
360 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  23.62 
 
 
324 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  26.92 
 
 
418 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  26.92 
 
 
426 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  26.92 
 
 
427 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  26.51 
 
 
355 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  26.92 
 
 
457 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  27.67 
 
 
439 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  27.67 
 
 
439 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  27.67 
 
 
439 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  27.81 
 
 
391 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  27.67 
 
 
439 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  28.3 
 
 
443 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  24.6 
 
 
352 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  24.2 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  27.67 
 
 
439 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  26.01 
 
 
411 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  27.67 
 
 
439 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  28.76 
 
 
357 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  27.67 
 
 
439 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  29.11 
 
 
409 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  27.22 
 
 
175 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  25.43 
 
 
344 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  25.66 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0206  hypothetical protein  24.62 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.300628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  28.38 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  25 
 
 
398 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  27.52 
 
 
396 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  24.66 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>