51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2317 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  99.31 
 
 
291 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  99.31 
 
 
291 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  78.28 
 
 
296 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  81.37 
 
 
266 aa  428  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  79.1 
 
 
270 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  78.73 
 
 
270 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  78.36 
 
 
270 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  67.08 
 
 
255 aa  344  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  65.37 
 
 
255 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  60.08 
 
 
261 aa  316  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  62.88 
 
 
319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  60.61 
 
 
263 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  55.33 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  49.13 
 
 
243 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  32.35 
 
 
238 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  31.25 
 
 
237 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  31.94 
 
 
237 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  30.77 
 
 
237 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  30.36 
 
 
238 aa  99  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  30.43 
 
 
238 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  30.56 
 
 
223 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  24.57 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  24.23 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  25.55 
 
 
238 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  29.95 
 
 
238 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  29.95 
 
 
238 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  29.03 
 
 
244 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  29.47 
 
 
236 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  28.99 
 
 
236 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  28.5 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  29.26 
 
 
246 aa  82  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  28.5 
 
 
236 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  28.8 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  29.51 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  29.95 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  25.11 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  24.68 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  25.73 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  23.94 
 
 
259 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  24.29 
 
 
218 aa  62.4  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  25.97 
 
 
418 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  25.97 
 
 
418 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  23.45 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  25.97 
 
 
435 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  26.12 
 
 
238 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  19.9 
 
 
249 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  30.93 
 
 
433 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  24.07 
 
 
443 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  27.18 
 
 
352 aa  42.4  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>