53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0551 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  93.75 
 
 		 256 aa  494  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  64.29 
 
 		 238 aa  315  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  33 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  31.6 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  32.67 
 
 		 236 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  33.17 
 
 		 236 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  27.16 
 
 		 319 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  27.5 
 
 		 296 aa  95.9  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  26.01 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  29.31 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  30.14 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  32.18 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  28.91 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  28.32 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  28.91 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  27.11 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  27.06 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  27.06 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  30.62 
 
 		 237 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  26.46 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  26.89 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  30.56 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  28.82 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  27.96 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  26.61 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  24.23 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  24.23 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  24.23 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  24.23 
 
 		 291 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  27.23 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  26.2 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  24.58 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  24.75 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  25.98 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  23.53 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  27.23 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  31.51 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  22.48 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  25.54 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  28.03 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0598  hypothetical protein  30.91 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  25.53 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  27.27 
 
 		 439 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  27.27 
 
 		 439 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  27.27 
 
 		 439 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  27.27 
 
 		 439 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  27.27 
 
 		 439 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  27.27 
 
 		 439 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  27.27 
 
 		 439 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  27.34 
 
 		 435 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  25.97 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  36.07 
 
 		 398 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>