34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2255 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  48.13 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  29.85 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  29.89 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  27.48 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  27.48 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  29.01 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  31.85 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  26.09 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  25.89 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  28.24 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  28.24 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  27.48 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  23.26 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  22.48 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  26.72 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  25.95 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  24.43 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  23.66 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  34.91 
 
 		 443 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  25.81 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  24.43 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  26.27 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  30.48 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  30.48 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  30.48 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  30.48 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  30.48 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  30.48 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  30.48 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  26.12 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  26.12 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  26.12 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  23.62 
 
 		 243 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>