46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2810 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  36 
 
 
236 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  35.5 
 
 
236 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  34.47 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  36 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  35.5 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  33.17 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  33.98 
 
 
237 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  32.89 
 
 
246 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  32.13 
 
 
238 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  34.31 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  34.31 
 
 
238 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.83 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  27.23 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  27.66 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  26.01 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  25.96 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  27.96 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  29.85 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  29.92 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  24.62 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  29.11 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  27.96 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  25.24 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  29.51 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  29.1 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  29.51 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  24.78 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  31.13 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  25.64 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  28.3 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  25.42 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  25.42 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  29.03 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  23.38 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  23.56 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  25.65 
 
 
319 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  23.48 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  26.87 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  23.18 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  23.03 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  24.67 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  23.75 
 
 
360 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0598  hypothetical protein  26.97 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574132  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>