70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36910 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  70.59 
 
 
238 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  65.96 
 
 
238 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  65.53 
 
 
238 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  66.2 
 
 
236 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  63.93 
 
 
237 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  66.2 
 
 
236 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  66.2 
 
 
236 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  65.28 
 
 
236 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  63.47 
 
 
237 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  61.64 
 
 
237 aa  288  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  36.12 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  33.49 
 
 
246 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  29.51 
 
 
255 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  32.13 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  34.39 
 
 
319 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  31.82 
 
 
255 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  30.21 
 
 
266 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  29.91 
 
 
270 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  29.91 
 
 
270 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  29.91 
 
 
270 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  29.78 
 
 
296 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  30.4 
 
 
261 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  31.3 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  30.87 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  33.04 
 
 
223 aa  95.5  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  28.99 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.88 
 
 
259 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  28.5 
 
 
291 aa  89.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  31.16 
 
 
252 aa  89  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  31.6 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  31.14 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  29.44 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  28.04 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  26.55 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  26.55 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  26 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  26.85 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  26.94 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  30.09 
 
 
457 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  30.09 
 
 
427 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  24.88 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1723  hypothetical protein  24.23 
 
 
285 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.836094  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  26.72 
 
 
238 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  29.2 
 
 
460 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  29.2 
 
 
418 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  29.2 
 
 
435 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  29.2 
 
 
418 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  26.09 
 
 
326 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1652  putative secreted protein  23.35 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  24.79 
 
 
360 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  26.09 
 
 
433 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  28.32 
 
 
426 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  26.96 
 
 
409 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  24.14 
 
 
344 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  28.75 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  26.7 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  25.22 
 
 
435 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  28.75 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  28.75 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  28.75 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  28.75 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  28.75 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  28.75 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  24.44 
 
 
355 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  28.21 
 
 
443 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>