31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02237 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  71.37 
 
 		 273 aa  350  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1723  hypothetical protein  56.52 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.836094  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1652  putative secreted protein  55.8 
 
 		 285 aa  311  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  37.77 
 
 		 227 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  35.58 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  34.07 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  33.19 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  27.63 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  26.85 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  27.03 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  28.72 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  27.69 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  25.88 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  25.2 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  26.94 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  26.94 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  26.94 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  25.22 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  22.03 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  26.56 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  24.7 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  26.18 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  26.04 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  23.24 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  26.18 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  24.19 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  22.17 
 
 		 270 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  22.17 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  24.37 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  21.72 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>