49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2601 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  78 
 
 		 255 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  68.83 
 
 		 261 aa  346  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  66.53 
 
 		 263 aa  344  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  63.53 
 
 		 266 aa  328  7e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  67.08 
 
 		 291 aa  327  9e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  67.08 
 
 		 291 aa  327  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  68.4 
 
 		 270 aa  325  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  68.4 
 
 		 291 aa  324  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  68.4 
 
 		 270 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  68.4 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  68.83 
 
 		 270 aa  322  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  63.45 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  54.37 
 
 		 319 aa  291  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  56.54 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  54.34 
 
 		 243 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  32.39 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  31.54 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  31.73 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  30.7 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  31.4 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  31.48 
 
 		 238 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  26.5 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  29.84 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  29.78 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  26.79 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  31.4 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  26.01 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  31.4 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  29.95 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  28.99 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  28.5 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  28.5 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  27.78 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  27.39 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  29.11 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  27.41 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  27.03 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  32.63 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  26.09 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  24.07 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1496  hypothetical protein  28.66 
 
 		 268 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  23.18 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  29.09 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  24.72 
 
 		 398 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0598  hypothetical protein  22 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1652  putative secreted protein  26.19 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1723  hypothetical protein  26.19 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.836094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>