39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2491 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  45.81 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  31.72 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  34.74 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  30.91 
 
 		 319 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  31.96 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  30.7 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  31.08 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  29.73 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  33.49 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  32.29 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  32.74 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  32.11 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  33.48 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  31.25 
 
 		 243 aa  91.7  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  31.56 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  30.63 
 
 		 270 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  30.63 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  31.65 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  31.46 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  29.73 
 
 		 270 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  30.09 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  30.56 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  30.56 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  30.56 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  30.56 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  31.1 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  30.62 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  31.1 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  28.04 
 
 		 244 aa  72  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  27.54 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  25.81 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  26 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  24.64 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  25.53 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  24.67 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  23.35 
 
 		 255 aa  42  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  25.62 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>