44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0944 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  37.74 
 
 
237 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  36.44 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  37.62 
 
 
236 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  37.62 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  36.28 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  36.19 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  36.67 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  36.67 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  36.19 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  35.81 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  36.67 
 
 
236 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  32.89 
 
 
246 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  29.24 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  28.19 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  27.65 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  27.78 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  29.47 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  29.2 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.19 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  28.09 
 
 
291 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  27.39 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  28.09 
 
 
291 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  28.09 
 
 
291 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  26.97 
 
 
270 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  27.66 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  28.09 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  27.43 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  30.74 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  35.37 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  28 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  26.34 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  26.52 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  25.76 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  27.09 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  26.09 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  26.75 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  27.67 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  26.2 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  28.87 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  27.54 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  31.85 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  30.37 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  27.59 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>