41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02150 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  45.81 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  31.58 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  31.54 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  31.6 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  33.19 
 
 		 319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  31.46 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  34.1 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  32.31 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  29.87 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  29.24 
 
 		 261 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  31.88 
 
 		 270 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  31.44 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  32.03 
 
 		 291 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  32.03 
 
 		 291 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  31.09 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  30.87 
 
 		 291 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  31.6 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  29.57 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  32.21 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  30.62 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  29.67 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  29.67 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  30.81 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  30.62 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  29.29 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  28.79 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  30.74 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  28.79 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  23.48 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  25.44 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  23.59 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  24.45 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  27.55 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  23.53 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  24.44 
 
 		 275 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  37.31 
 
 		 401 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  23.68 
 
 		 273 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  29.21 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>