18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0964 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  72.94 
 
 		 275 aa  348  6e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1723  hypothetical protein  53.43 
 
 		 285 aa  288  8e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.836094  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1652  putative secreted protein  53.07 
 
 		 285 aa  285  8e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  42.11 
 
 		 227 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  36.06 
 
 		 218 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  35.41 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  35.41 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  26.94 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  27.78 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  26.09 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  26.54 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  26.07 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  26.18 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  26.9 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  24.76 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  23.98 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  23.68 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>