41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02236 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  70.37 
 
 		 227 aa  332  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  64.52 
 
 		 227 aa  300  9e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  64.06 
 
 		 227 aa  298  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  36.36 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  35.58 
 
 		 275 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1652  putative secreted protein  28.91 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1723  hypothetical protein  29.19 
 
 		 285 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.836094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  29.05 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  28.04 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  26.52 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  24.11 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  27.17 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  24.89 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  27.96 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  29.03 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  27.14 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  26.13 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  24.2 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  24.02 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  24.02 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  24.02 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  23.81 
 
 		 266 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  24.02 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  26.79 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  27.22 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  24.23 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  27.22 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  26.63 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  26.63 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  25.59 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  22.86 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  24.58 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  22.86 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  22.86 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  25.69 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  25.44 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  32.29 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  24.58 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  25.81 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  27.08 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>