44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1871 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  65.33 
 
 		 291 aa  315  8e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  54.37 
 
 		 255 aa  291  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  62.88 
 
 		 291 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  62.88 
 
 		 291 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  62.88 
 
 		 291 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  61.03 
 
 		 255 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  62.88 
 
 		 291 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  62.28 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  58.65 
 
 		 261 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  55.6 
 
 		 266 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  58.69 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  63.21 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  62.26 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  62.26 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  49.29 
 
 		 243 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  35.05 
 
 		 237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  34.39 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  34.58 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  33.19 
 
 		 238 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  32.55 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  34.58 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  30.91 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  30.32 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  33.82 
 
 		 236 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  27.16 
 
 		 256 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  27.73 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  32.37 
 
 		 236 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  27.73 
 
 		 238 aa  94  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  32.85 
 
 		 236 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  31.22 
 
 		 238 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  31.22 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  27.23 
 
 		 244 aa  86.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  28.43 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  25.65 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  32.29 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.06 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  32.29 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  22.6 
 
 		 460 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  27.45 
 
 		 227 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  27.45 
 
 		 227 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  25.93 
 
 		 398 aa  42.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>