51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1868 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  53.22 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  49.38 
 
 		 261 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  49.38 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  49.77 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  50.22 
 
 		 291 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  49.1 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  47.97 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  47.97 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  49.13 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  45.45 
 
 		 296 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  48.7 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  48.26 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  48.26 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  48.32 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  49.28 
 
 		 291 aa  215  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  31.88 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  30.7 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  27.56 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  28.99 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  27.48 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  28.38 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  31.28 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  27.54 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  27.54 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  27.27 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  27.7 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  26.57 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  27.23 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  26.57 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  26.73 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  27.91 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  26.24 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  26.97 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  25.74 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.96 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  30.15 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  27.67 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  24.2 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  22.69 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  26.4 
 
 		 398 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  25.12 
 
 		 352 aa  48.5  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  27.47 
 
 		 411 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  22.58 
 
 		 409 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  19.41 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  18.83 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  23.85 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  27.51 
 
 		 393 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  26.92 
 
 		 360 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  21.92 
 
 		 275 aa  42  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  21.24 
 
 		 433 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>