49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0194 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  824    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  58.73 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  59.95 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  52.81 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  53.8 
 
 		 439 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  53.8 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  53.8 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  53.8 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  52.37 
 
 		 426 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  53.8 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  50.13 
 
 		 427 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  51.16 
 
 		 418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  51.16 
 
 		 418 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  56.5 
 
 		 460 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  50.87 
 
 		 435 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  55.72 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  65.52 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  65.09 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  46.85 
 
 		 344 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  47.3 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  47.37 
 
 		 355 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  41.71 
 
 		 326 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  39.23 
 
 		 334 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  37.18 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  33.83 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  29.52 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  31.09 
 
 		 257 aa  86.3  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  27.4 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  27.4 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  27.81 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  31.78 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  32.74 
 
 		 175 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  27.7 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  27.18 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  28.18 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  25.67 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  26.01 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  28.32 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  31.82 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  27.04 
 
 		 324 aa  46.6  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  30.18 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  27.43 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  26.91 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  26.44 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  22.78 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  43.5  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  28.87 
 
 		 236 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  28.87 
 
 		 236 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>