38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0438 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  778    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  97.52 
 
 		 404 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  66.09 
 
 		 231 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  63.4 
 
 		 391 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  55.86 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  41.1 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  50.47 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  53.43 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  45.28 
 
 		 411 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  31.63 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  30.37 
 
 		 435 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  30.37 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  30.37 
 
 		 418 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  30.37 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  32.14 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  34.9 
 
 		 257 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  31.28 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  31.28 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  31.28 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  31.28 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  31.28 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  31.28 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  31.28 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  40.51 
 
 		 175 aa  92.8  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  29.17 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  28.86 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  28.86 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  27.4 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  31.08 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  25.33 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  29.73 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  28 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.6 
 
 		 1888 aa  63.9  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0206  hypothetical protein  25.52 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.300628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  27.14 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  25.33 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  24.48 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  26.75 
 
 		 326 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>