44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0990 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  752    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  63.68 
 
 
404 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  63.68 
 
 
404 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  59 
 
 
231 aa  260  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  53.62 
 
 
398 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  49.52 
 
 
396 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  47.42 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  53.73 
 
 
357 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  43.75 
 
 
411 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  35.9 
 
 
257 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  32.97 
 
 
435 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  39.53 
 
 
175 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  34.22 
 
 
326 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  33.79 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  31.11 
 
 
460 aa  96.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  31.25 
 
 
418 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  32.24 
 
 
433 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  31.25 
 
 
418 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  31.25 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  31.87 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  31.11 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  29.79 
 
 
457 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  29.79 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  30.6 
 
 
439 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  30.94 
 
 
439 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  30.94 
 
 
439 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  30.05 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  30.05 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  30.05 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  30.05 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  27.81 
 
 
409 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  32.58 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  33.18 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  32.83 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  30.14 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  29.8 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  27.7 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  29 
 
 
355 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  27.75 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  30.77 
 
 
232 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  28.04 
 
 
254 aa  56.6  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0206  hypothetical protein  23.92 
 
 
231 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.300628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  27.81 
 
 
244 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  29.17 
 
 
245 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>