43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6257 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  842    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  80.29 
 
 
457 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  87.83 
 
 
418 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  87.57 
 
 
435 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  87.14 
 
 
418 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  82.4 
 
 
427 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  78.89 
 
 
460 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  60.22 
 
 
439 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  52.43 
 
 
433 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  62.83 
 
 
443 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  49.32 
 
 
435 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  54.9 
 
 
409 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  73.76 
 
 
439 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  73.3 
 
 
439 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  73.3 
 
 
439 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  73.3 
 
 
439 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  73.3 
 
 
439 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  73.3 
 
 
439 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  46.7 
 
 
355 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  44.55 
 
 
360 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  45 
 
 
344 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  42.92 
 
 
326 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  40.67 
 
 
334 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  28.49 
 
 
324 aa  141  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  35.71 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  31.64 
 
 
393 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  30.94 
 
 
396 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  30.21 
 
 
404 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  30.21 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  31.58 
 
 
391 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  30.65 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  29.9 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  31.25 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  32.76 
 
 
175 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  28.11 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  24.4 
 
 
352 aa  60.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  30.14 
 
 
400 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  28 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  28.11 
 
 
238 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  27.56 
 
 
244 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  30.14 
 
 
238 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  30.14 
 
 
238 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  28.32 
 
 
238 aa  46.6  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>