50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0160 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  100 
 
 		 344 aa  678    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  86.67 
 
 		 360 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  64.27 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  39.78 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  51.75 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  38.67 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  49.78 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  40.34 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  38.08 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  37.82 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  40.24 
 
 		 426 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  44.93 
 
 		 460 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  46.49 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  46.49 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  46.49 
 
 		 439 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  46.49 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  46.49 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  46.12 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  46.12 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  44.1 
 
 		 418 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  44.1 
 
 		 418 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  45.61 
 
 		 443 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  43.67 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  35.4 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  31.25 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  27.15 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  31.22 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  31.22 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  28.76 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  31.82 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  30.26 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  29.51 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  30.09 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  31.51 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  29.09 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  27.8 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  25.52 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  26.13 
 
 		 232 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  49.7  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  26.55 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  31.15 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  23.04 
 
 		 236 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  28.12 
 
 		 236 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  21.58 
 
 		 236 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  26.13 
 
 		 237 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  24.31 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  25.23 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  24.78 
 
 		 238 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  23.93 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>