44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0612 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  700    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  45.82 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  51.46 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  53.43 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  53.43 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  52.22 
 
 		 396 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  47.8 
 
 		 411 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  50.49 
 
 		 231 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  44.61 
 
 		 398 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  33.49 
 
 		 257 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  38.18 
 
 		 175 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  30.2 
 
 		 443 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  30.88 
 
 		 457 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  30.88 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  30.3 
 
 		 439 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  30.3 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  30.3 
 
 		 439 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  30.3 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  30.3 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  30.39 
 
 		 418 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  30.3 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  30.3 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  30.39 
 
 		 418 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  30.39 
 
 		 435 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  29.9 
 
 		 426 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  29.76 
 
 		 460 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  32.18 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  31.07 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  31.07 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  33.02 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  33.51 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  27.18 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  28.5 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  29.68 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  30.66 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  28.17 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  28.89 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  28.77 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0206  hypothetical protein  26.42 
 
 		 231 aa  57  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.300628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  30.09 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  28.73 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  28.76 
 
 		 244 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  26.67 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  27.06 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>