52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2929 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  98.56 
 
 		 418 aa  815    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  830    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  98.33 
 
 		 435 aa  814    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  88.78 
 
 		 426 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  84.26 
 
 		 457 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  83.5 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  78.02 
 
 		 460 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  59.6 
 
 		 439 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  49.17 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  59.06 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  50.71 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  52.14 
 
 		 409 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  75.23 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  74.77 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  74.77 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  74.77 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  74.77 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  74.77 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  46.43 
 
 		 355 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  44.09 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  44.09 
 
 		 344 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  42.45 
 
 		 326 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  40.67 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  35 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  36.26 
 
 		 411 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  31.55 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  32.04 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  30.77 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  30.77 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  31.25 
 
 		 391 aa  92.8  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  28.91 
 
 		 231 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  30.39 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  31.82 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  33.14 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  27.57 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  27.83 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  30.14 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  24.4 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  27.8 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  28.65 
 
 		 238 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  27.56 
 
 		 244 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  25.58 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  29.2 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  30.14 
 
 		 238 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  30.14 
 
 		 238 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  26.8 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  23.53 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  30.63 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  25.77 
 
 		 236 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  26.14 
 
 		 236 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  23.63 
 
 		 324 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  25.99 
 
 		 236 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>