53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0416 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  98.63 
 
 
439 aa  857    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  98.63 
 
 
439 aa  857    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  98.63 
 
 
439 aa  857    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  98.63 
 
 
439 aa  857    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  98.63 
 
 
439 aa  858    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  98.63 
 
 
439 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  872    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  79.3 
 
 
443 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  60 
 
 
457 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  59.44 
 
 
427 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  62.61 
 
 
435 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  62.91 
 
 
418 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  62.61 
 
 
418 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  59.94 
 
 
426 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  52.64 
 
 
433 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  59.76 
 
 
460 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  51.19 
 
 
435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  53.33 
 
 
409 aa  362  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  45.45 
 
 
344 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  45.45 
 
 
360 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  44.49 
 
 
355 aa  199  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  44.08 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  36.55 
 
 
324 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  40.1 
 
 
334 aa  156  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  38.22 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  31.9 
 
 
393 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  31.58 
 
 
396 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  32.46 
 
 
257 aa  90.5  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  29.7 
 
 
357 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  32.38 
 
 
231 aa  87.4  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  30.77 
 
 
391 aa  86.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  32.69 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  34.71 
 
 
175 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  29.19 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  26.48 
 
 
352 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  28.25 
 
 
401 aa  60.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  26.47 
 
 
404 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  26.47 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  26.64 
 
 
400 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  27.66 
 
 
238 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  27.27 
 
 
238 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  27.65 
 
 
236 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  29.82 
 
 
244 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  27.8 
 
 
232 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  28.1 
 
 
254 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  23.94 
 
 
245 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  26.52 
 
 
256 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  25.88 
 
 
236 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  33.94 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  28.95 
 
 
238 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  28.66 
 
 
324 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  25.41 
 
 
237 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>