33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3265 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  727    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  38.79 
 
 		 257 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  40.8 
 
 		 175 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  95.9  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  33.64 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  35.81 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  33.65 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  32.86 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  33.18 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  32.38 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  32.38 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  32.38 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  32.38 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  35.43 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  32.38 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  32.38 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  32.38 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  31.63 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  31.58 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  33.79 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  30.14 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  32.23 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  29.55 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  27.82 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  27.82 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  27.8 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  27.8 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  27.35 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  28.63 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.52 
 
 		 2449 aa  46.6  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  29.07 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  28.99 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>