43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3631 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  100 
 
 		 175 aa  348  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  47.65 
 
 		 257 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  40.23 
 
 		 377 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  39.53 
 
 		 391 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  38.18 
 
 		 357 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  38.82 
 
 		 393 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  41.67 
 
 		 231 aa  97.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  37.42 
 
 		 411 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  40.51 
 
 		 404 aa  96.3  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  40.51 
 
 		 404 aa  95.5  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  38.82 
 
 		 396 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  39.1 
 
 		 398 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  36.9 
 
 		 460 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  33.87 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  33.71 
 
 		 439 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  33.71 
 
 		 439 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  33.71 
 
 		 439 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  33.71 
 
 		 439 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  33.14 
 
 		 418 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  32.76 
 
 		 418 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  32.76 
 
 		 426 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  34.32 
 
 		 439 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  34.32 
 
 		 439 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  34.32 
 
 		 439 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  33.14 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  32.74 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  32.74 
 
 		 435 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  33.53 
 
 		 443 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  32.54 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  29.51 
 
 		 360 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  29.51 
 
 		 344 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  31.65 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  35.29 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  31.49 
 
 		 324 aa  65.1  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  33.54 
 
 		 326 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  27.22 
 
 		 244 aa  48.5  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  29.94 
 
 		 352 aa  44.7  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  23.74 
 
 		 254 aa  41.6  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  28.12 
 
 		 401 aa  41.6  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  28.65 
 
 		 255 aa  40.8  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>