39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0083 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  59.15 
 
 		 326 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  50.22 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  50.22 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  48.87 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  39.76 
 
 		 457 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  40.93 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  40.48 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  40.48 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  40.48 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  40 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  41.15 
 
 		 435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  36.13 
 
 		 409 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  40.58 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  40.67 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  39.72 
 
 		 460 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  40.1 
 
 		 439 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  40.1 
 
 		 439 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  40.1 
 
 		 439 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  40.1 
 
 		 439 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  40.1 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  40.1 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  40.1 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  32.55 
 
 		 411 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  25.86 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  28.96 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  32.21 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  32.29 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  28.3 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  31.45 
 
 		 175 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  26.91 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  24.62 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  25.68 
 
 		 244 aa  52.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  27.54 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  26.17 
 
 		 400 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  23.71 
 
 		 232 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  24.59 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  23.61 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  25.33 
 
 		 245 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>