49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0712 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  39.72 
 
 
244 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  29.2 
 
 
296 aa  79  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  29.57 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  29.57 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  28.76 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  29.57 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  29.52 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  29.13 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  28.76 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  27.06 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  29.57 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  29.85 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  28.83 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  27.95 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  29.07 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  25.96 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  30.15 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  25.44 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  28.76 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  28.86 
 
 
236 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  28.38 
 
 
261 aa  62.4  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  25.22 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  23.98 
 
 
238 aa  62  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  24.88 
 
 
227 aa  62  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  23.01 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  26.46 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  27.45 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  26.46 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  27.45 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  25.12 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  25.59 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  24.15 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  29.71 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  26.61 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  26.39 
 
 
326 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  25.22 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  26.52 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  26.42 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  23.44 
 
 
223 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  26.47 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  24.43 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  27.64 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  22.58 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  23.62 
 
 
324 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  25.16 
 
 
411 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  30.34 
 
 
404 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  30.34 
 
 
404 aa  42.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  27.69 
 
 
391 aa  42.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>